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[涨姿势] 世界上最后一种野马的基因组图谱已成功绘制

作者:精品下载站 日期:2024-12-13 17:01:28 浏览:14 分类:涨姿势

世界上最后一种野马的基因组图谱已成功绘制


人们希望基因组能够成为保护的有用工具。

[涨姿势] 世界上最后一种野马的基因组图谱已成功绘制

有趣的事实:普氏野马有 66 条染色体,而家养马有 64 条。

图片来源:Iceskatinggrizzly/Shutterstock.com

普氏野马于 20 世纪 60 年代在野外灭绝后,现在开始重返中亚平原的故乡。为了帮助保护工作,明尼苏达大学的研究人员成功绘制了该物种的整个基因组图谱。

基因组学是对生物体整体 DNA 的研究,在保护中发挥着重要作用。它可以让科学家深入了解种群的多样性——这有助于避免近亲繁殖——以及其特征的遗传基础,尤其是那些可能影响健康的特征。

然而,为了以这种方式使用基因组学,首先必须有一个可以比较的东西——参考基因组。普氏野马的马匹已经有了一个,但团队希望对其进行改进。

“在没有良好参考的情况下研究基因就像在做一个 30 亿块拼图,但盒子上没有图片,”共同领导这项描述基因组图谱生成的研究的 Nicole Flack 在一份声明中说。 “普氏原羚的马研究人员研究重要基因的突变,需要一张好的参考图片来比较他们的谜题。 ”

为此,研究人员首先从明尼苏达动物园饲养的 10 岁普氏野马 Varuschka 身上采集了血液样本,它是曾经生活在蒙古的该物种野生成员的后裔。

下一步是测序并组装参考基因组。这是通过一个只有汽水罐大小的设备完成的——在过去的几年里,基因组学已经从占据实验室空间的大型机器中取得了长足的进步。这类设备非常便携,这意味着它们可以在现场用于研究生活在偏远地区的普氏野马种群的基因组。

结果发现,所得到的参考基因组的 BUSCO 分数接近 99%,这是衡量基因组完整性的指标,这表明该基因组将为自然资源保护主义者提供相当可靠的参考。

由于气候变化、栖息地丧失、资源竞争和狩猎,普氏野马在 20 世纪几乎完全灭绝。尽管如此,该物种还是在 12 匹野外捕获的马中幸存了下来。由于保护工作的努力,目前其数量约为 2,000 只,其中一些最近甚至被重新引入哈萨克斯坦的黄金草原。

然而,普氏野马仍然被认为濒临灭绝。作为世界上仅存的最后一批真正的野马,这些保护工作,包括创建参考基因组,变得更加重要。 “高度连续的参考基因组的可用性对于支持这些持续的努力至关重要。 [……]这种改进的普氏野马组装将成为一种宝贵的资源,”研究作者写道。

该研究发表在 G3 上。

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